नीबी टीएम रिक्तता तापमान कैलकुलेटर

क्या आप NEB TM की तापमान गणना के लिए Wallace et al की समीकरणा का उपयोग करने वाली एक खलनायन तापमान कैलकुलेटर ढूंढ रहे हैं? तो आप सही जगह पर आए हैं!

अनिलिंग तापमान (Tm) वह तापमान होता है जिस पर प्रारंभक या प्राइमर डीएनए के संकेतकों को पूरक डीएनए के संकेत से जोड़ते हैं या "चारा" बँधाते हैं (हाइड्रोजन सेतुओं का ब्रिज बनाते हैं), जिससे पॉलिमेरेज़ द्वारा विस्तार संभव होता है। अनिलिंग का आदर्श तापमान प्रारंभकों के अनुक्रम और प्रतिक्रिया की स्थितियों जैसे प्रतिक्रिया बफर, आयनों की घनत्व और प्रारंभकों की घनत्व के आधार पर निर्भर करता है। अनिलिंग के सही तापमान का चयन पीसीआर में सटीक और विशेष परिणाम प्राप्त करने के लिए महत्वपूर्ण होता है।

कई पीसीआर अनिलींग तापमान की गणना के लिए कई समीकरण होते हैं, जिनमें सबसे आम Wallace et al. का समीकरण है। यह समीकरण प्रारंभकों की वाक्यश्रृंखाएँ और प्रारंभकों की सांद्रता के साथ-साथ प्रारंभकों की गुणमान के साथ-साथ प्रारंभक वाक्यश्रृंखाओं में जीसी के जोड़े की संख्या को भी ध्यान में रखता है। Tm निकालने के लिए सूत्र निम्नलिखित है:

Tm = 64.9 + 41*(गुआनिन + साइटोसिन - 16.4)/(अडेनिन + थाइमिन + गुआनिन + साइटोस

कहाँ:

टीएम = सेल्सियस डिग्री में अनिलिंग तापमान
ए, टी, जी, सी = प्रारंभक सूक्ष्मांक अनुक्रम में एडेनिन, थाइमिन, गुआनिन और साइटोसिन के नाइट्रोटाइड्स की संख्या
पी = प्रारंभक सूक्ष्मांक अनुक्रम में बेस जीसी के जोड़ों की संख्या

वालेस आदि का समीकरण केवल एक से मोहित समीकरणों में से एक है जो टीएम की गणना के लिए उपलब्ध है, लेकिन इसकी सटीकता और उपयोग की सुविधा के कारण इसे व्यापक रूप से प्रयोग किया जाता है।

अनुशासनात्मक गणनाकर्ता वालेस इत एल का सुधारित तापमान कैलकुलेटर

यह कैलकुलेटर Wallace आदि की समीक्षा के आधार पर Tm की गणना के लिए प्रारंभक सीक्वेंस और प्रारंभक आवेग की श्रेणी का उपयोग करता है।

हमारी NEB TM कैलकुलेटर के बारे में

कैलकुलेटर नेब पीसीआर प्रोडक्ट के साथ उपयोग के लिए डिज़ाइन किया गया था। पहला कदम यह है कि आपको पीसीआर रिएक्शन में उपयोग करने वाला नेब पीसीआर प्रोडक्ट चुनना है। इससे रिएक्शन की उचित शर्तें और Tm की सही गणना के लिए सहायता मिलेगी।

उपयोग करने के लिए, कैलकुलेटर में प्रारंभकों की अनुक्रमिकता दर्ज करें। सुनिश्चित करें कि आप प्रारंभकों की अनुक्रमिकता को सही क्रम में दर्ज कर रहे हैं - पहले प्रारंभकों को पहले बॉक्स में और दूसरे प्रारंभकों को दूसरे बॉक्स में। कैलकुलेटर इनिशिएटर के श्रृंखलाओं में उपेक्ष्य तकनीकी (कोड "N", "R", "Y" आदि द्वारा प्रतिनिधित) तकनीकी को अधिकतम 3 आधारों की अनुमति देता है।

आवश्यक जानकारी दर्ज करने के बाद, "Tm की गणना" बटन पर क्लिक करें। कैलकुलेटर वालेस इट एल. के समीकरण का उपयोग करेगा और प्रारंभकों के अनुक्रमों और प्रारंभकों के लवण के आधार पर Tm की गणना करेगा।

कैलकुलेटर टेम्प्रेचर (Tm) को सेल्सियस डिग्री में "Tm की गणना करें" बटन के नीचे दिए गए बॉक्स में दिखाएगा। सुनिश्चित करें कि गणित Tm आपके उपयोग कर रहे NEB PCR उत्पाद के उचित तापमान सीमा में हो।

आनुक्रमणिक तापमान की अन्य रूपरेखाएँ

व्हालेस आदि की समीकरण के अलावा, पीसीआर अम्लीकरण के तापमान की गणना के लिए अन्य समीकरण हो सकते हैं जो प्रारंभकों के सरणियों पर आधारित होते हैं। यहां कुछ और सामान्य समीकरण हैं:

ब्रेसलावर एट अल का सूत्र

ब्रेसलावर इत अल का सूत्र PCR रिंगीयता के तापमान की गणना के लिए सबसे प्राचीन और सामान्य समीकरणों में से एक है। समीकरण निम्नलिखित है:

Tm = 81.5 + 0.41*(जी + सी) - 675/N - पी + एस

कहाँ:

तापमान सहनबिल ग्रेड सेल्सियस में 
G, C = शुरू करने वाली अनुक्रम में ग्वानीन और साइटोसिन के नाबिपर 
N = अनुक्रम में कुल न्यूक्लीउटाइडों की संख्या 
P = शुरू करने वाली अनुक्रम में बेस पूर्णों की संख्या 
S = मोल/लीटर में नमक (Na+) की घनता

यह समीकरण अनुपातिक है, लेकिन यह दूसरे नवीनतम समीकरणों के तुलना में अधिक सटीक नहीं हो सकता।

सांतालूसिया एट अल का सूत्र

सांतालूशिया एल. का सूत्र PCR के अनिलन समय की गणना के लिए एक नया और सटीक सूत्र है। इस सूत्र को निम्नलिखित रूप में दिया गया है:

Tm = १००.५ + ४१*(G - C/२)/(A + T + G + C) - ८२०/dH - १६.६*log10(S/१०००)

कहाँ:

इसे अनुवाद नहीं किया जा सकता है।

यह समीकरण पायस के संवादन रों को ध्यान में रखता है, जो प्रयोक्षात्मक रूप से मापा जा सकता है, साथ ही पीसीआर के प्रतिक्रिया में नमक की अधिकता को।