NEB TM アニーリング温度計算機

Wallace らの式を使用して NEB TM をオンラインで計算するアニーリング温度計算機をお探しですか?それなら、あなたは正しい場所に来ました!

アニーリング温度 (Tm) は、1 つまたは複数のプライマーが DNA の相補鎖に結合または「アニーリング」(水素結合を形成) し、ポリメラーゼによる伸長を可能にする温度です。最適なアニーリング温度は、プライマー配列と、反応バッファー、イオン濃度、プライマー濃度などの反応条件によって異なります。アニーリング温度を正しく選択することは、PCR 反応で正確かつ特異的な結果を得るために非常に重要です。

PCR アニーリング温度を計算するために使用できる式がいくつかあります。Wallace らによって最も一般的に使用されている式です。この式は、プライマー配列とプライマー濃度、およびプライマー配列内の GC 塩基対の数を考慮に入れています。 Tm の計算式は次のとおりです。

Tm = 64.9 + 41*(G + C - 16.4)/(A + T + G + C - 16.4 - 2*P) - 500/(A + T + G + C + 0.41*P)

どこ:

Tm = 摂氏でのアニーリング温度 A、T、G、C = プライマー配列中のアデニン、チミン、グアニン、シトシンヌクレオチドの数 P = プライマー配列中の GC 塩基対の数

ウォレス等。は、Tm の計算に使用できるいくつかの式の 1 つにすぎませんが、その精度と使いやすさから広く使用されています。

リング温度計算機 Wallace et al 方程式

電卓は Wallace らを使用します。プライマー配列とプライマー濃度に基づいて Tm を計算します。









NEB TM Calculatorについて

この計算機は、NEB PCR 製品で使用するように設計されています。最初のステップは、PCR 反応で使用する予定の NEB PCR 産物を選択することです。これは、適切な反応条件と Tm を計算するための正しい式を決定するのに役立ちます。

使用するには、プライマー配列を電卓に入力します。最初のスターターを最初のボックスに、2 番目のスターターを 2 番目のボックスに、正しい順序でシーケンスを入力してください。電卓では、プライマー シーケンス内のあいまいな塩基 (コード「N」、「R」、「Y」などで表される) を 3 つまで使用できます。

必要事項を入力後、「Tm計算」ボタンをクリックしてください。電卓はウォレスらを使用します。プライマー配列とプライマー濃度に基づいて Tm を計算します。

電卓は、「Tm の計算」ボタンの下のテキスト ボックスに計算された Tm を摂氏で表示します。計算された Tm が、使用している NEB PCR 製品の適切な温度範囲内にあることを確認してください。

リング温度を計算するその他の方法

Wallace らの式に加えて、プライマー配列に基づいて PCR アニーリング温度を計算するために使用できる他の式があります。その他の一般的な方程式を次に示します。

ブレスラウアー等式

Breslauer らによる式。は、PCR アニーリング温度を計算するための最も古く、最も一般的な式の 1 つです。方程式は次のように与えられます。

Tm = 81.5 + 0.41*(G + C) - 675/N - P + S

どこ:

Tm = 摂氏でのアニーリング温度 G、C = プライマー配列内のグアニンおよびシトシンヌクレオチドの数 N = プライマー配列内のヌクレオチドの総数 P = プライマー配列内の塩基対の数 S = 塩濃度 ( Na+ ) in mol/L

この方程式は比較的単純ですが、最近の他の方程式ほど正確ではない可能性があります。

SantaLuciaらによる式。

SantaLucia らによる式。は、PCR アニーリング温度を計算するための新しい、より正確な式です。方程式は次のように与えられます。

Tm = 100.5 + 41*(G - C/2)/(A + T + G + C) - 820/dH - 16.6*log10(S/1000)

どこ:

摂氏でのアニーリング温度 G、C = プライマー配列中のグアニンおよびシトシンヌクレオチドの数 A、T = プライマー配列中のアデニンおよびチミンヌクレオチドの数 dH = プライマーの変性エンタルピープライマー (cal/mol S) = 塩濃度 (Na+) (mol/L)

この方程式は、実験的に測定できるプライマーの変性エンタルピーと、PCR 反応における塩濃度を考慮に入れています。


電卓、アニメ、ゲーム、ドット絵、8ビット、自分が一番いいと思う絵が欲しい

このページを楽しんでいただければ幸いです: NEB TM アニーリング温度計算機

DigitalKW は、単純な訪問者の問題を解決するために設計されたツールを共有するサイトです。私たちのツールは通常、人工知能とその巨大なグローバル データベースの助けを借りて動作します。

使用しているツールでエラーが発生した場合は、ページを更新するか、サポートにお問い合わせください。さまざまな機能を実行するツールを提案または要求することもできます。

Whatsappのアイコン